"/" и "/index.php" считает за разные страницы
 

Такая проблема, считает "/" и "/index.php" разными страницами, и приходят заявки на "/index.php" по цене ссылки второго уровня.

В мыслях удалить страницу /index.php но, хочется все же узнать кто как решал такую проблему (вдруг что-то не то удалю :) )

У меня на одной площадке,вообще за третий уровень принял эти стр.:D

Надо было одну из них удалить еще перед модерацией площадки, а так вы сейчас обманываете оптимизаторов и по первому стуку вам площадку заблокируют.

Если боязно удалить, то заблокируйте до след. индексациии...

Когда возникает сомнение сколько морд у сайта - подойдите к зеркалу. И убедившись, что трезвы - посчитайте там количество морд. Обычно она там одна. Чернобыльцев - не берем в расчет.

Wink сказал верно - не доводите до стука и бана.
Чаще всего - индекс как раз и не нужна, причем никому :)

исключил /index.php