YAP "говорит" нет в Яндексе
 

Кнопка YAP "говорит "что странички нет в Яндексе(вероятно выпала из индексации) но когда я нажимаю на "[Пометить все ссылки, размещённые на отсутствующих в Яндексе сайтах],

то мне выскакивает окошко, что "ссылок размещенных , на отсутствующих в Яндексе сайтах,не найдено вэтом УРЛе"
как это понимать?

я не совсем понял что за кнопка

но, если яндекс говорит, что в яндексе нет вашей страницы, значит вашей страницы нет в яндексе :)
Ждите когда переиндексирует, что тут еще сказать

"ссылки, размещённые на отсутствующих в Яндексе сайтах", а не страницах. Т.е. проверяется только наличие в Я. сайта в целом, а не каждой его конкретной страницы.