Команда распределенных вычислений TSC! Russia просит помощи

[rilian]

rilian, т.е. по вашему т.к. задача не параллелится совсем, то все эти 5 млн компов тупо считаю 5 млн разных вариантов белков/условий

нет, они конечно не 5 млн вариантов считают, но одновременно идет несколько десятков экспериментов, в каждом может быть несколько тысяч "поколений" белка.

Кстати сейчас упор на рассчеты на видеокартах идет в том числе и потому, чтобы быстрее получать эти самые новые "поколения". Ведь важно не досчитать до конца, а вовремя понять какое из поколений полезно для дальнейшего изучения, а какое можно удалить

подробнее об этом написано на официальном сайте и форуме

Т.е. 1 молекула при 1 условиях = 1 комп. Так?

да, только не молекула, одно конкретное поколение белка в определенных начальных условиях. В фолдинге в основном изучаются белки из нескольких десятков тысяч атомов.

Еще учтите что одно и то же задание отправляется сразу на пару компьютеров, и потом посчитанные результаты сравниваются (и если совпадают, то ок, не совпадают - значит один из компов барахлит)